Porém, Kazuma Kiryu agora tenta viver de maneira pacífica ao lado de sua protegida, Haruka Sawamura, filha de Yumi. O antigo mafioso só decide se envolver quando um homem que vai buscar sua ajuda é assassinado por uma família rival. Logo, Kiryu procura por uma solução pacífica, mas descobre que nem tudo vai correr conforme o planejado.

Yakuza 3 continua a história em Kamurocho e introduz uma nova localidade: Ryukyu. Agora, Kiryu administra um orfanato, Morning Glory, onde lida com crianças e sua filha adotiva, Haruka. Após um certo período de paz, ele descobre que um de seus antigos aliados foi baleado, o que o leva a mais um período conturbado. O problema é: Kiryu acreditava que este aliado estava morto há um tempo. Como é possível?

Quando retorna ao seu local de operações, Kamurocho, Kazuma Kiryu descobre a existência de uma organização de tráfico que atua no mundo todo, a Black Monday, com envolvimento até mesmo da CIA, agência de inteligência norte-americana. Nesta trama internacional, o ex-mafioso precisa lidar com novas escolhas pessoais e encontrar fantasmas de seu passado.

Yakuza 4 dá uma breve pausa no foco em Kazuma Kiryu e introduz outros personagens importantes à história, com seus próprios dramas e problemas que se entrelaçam: Shun Akiyama, Taiga Saejima e Masayoshi Tanimura. Os quatro se unem para lidar com uma grande corrupção dentro da polícia, além de tratar de outras situações que envolvem suas próprias famílias e relacionamentos.

Um novo vilão consegue colocar na cadeia grandes membros do Clã Tojo, enquanto o quarteto tenta lidar com a situação para frear seu avanço. Com histórias paralelas, o grupo cruza seu caminho e tem apenas um destino ao final da história.

Yakuza 5 se faz valer dos novos personagens que a série introduziu e nos leva a uma história ainda mais complexa. O “herói” da saga, contudo, Kazuma Kiryu, tenta novamente viver uma nova vida. Ele muda seu nome para Suzuki Taichi e vive como taxista em Fukuoka. Enquanto isso, Haruka, sua protegida, se concentra seguir carreira como cantora pop japonesa, afastando-se de Kiryu para não criar conexões públicas com um antigo mafioso.

Porém, a jovem se envolve em problemas quando se junta a Shun Akiyama para investigar por conta própria o assassinato de sua agente, Mirei Park. Enquanto isso, Kiryu é forçado a, novamente, abandonar sua tentativa de vida pacata ao descobrir que há um plano para tirar sua vida e passar o controle dos Omi e Tojo. Cada personagem tenta seguir seu caminho, mas diversos problemas ocorrem, culminando com um combate decisivo de Kiryu e a revelação pública de Haruka sobre sua antiga vida.

Em Yakuza 6: The Song of Life, vemos a continuação direta dos fatos do game anterior. Após as revelações de Haruka, que prejudicam sua carreira como cantora, Kiryu procura se recuperar de seu grande combate, mas é preso logo em seguida. Depois que sai da prisão, ele procura Haruka no orfanato Morning Glory, mas é surpreendido com sua ausência.

Kiryu decide voltar à cidade para buscar Haruka, mas descobre outra intriga envolvendo a polícia e as máfias do local. Neste meio tempo, ele ainda toma conhecimento de um filho que Haruka teve - e precisa cuidar da criança.

Yakuza 0 se passa antes de todos os games listados acima, narrando as primeiras aventuras de Kazuma Kiryu no Clã Tojo, bem como os fatos que o levaram a conhecer pessoas influentes na área de crimes e de autoridades policiais.

O enredo toma lugar na década de 80, época em que Kazuma se torna suspeito de ter assassinado um homem importante. Ao longo da jornada, ele precisa lidar com o problema de ser procurado e reunir aliados.

A série Yakuza é recheada de outros games, alguns que ficaram apenas no Japão, outros que saíram em portáteis – é o caso de Yakuza Kurohyou, do PSP. Há ainda Yakuza Kenzan e Yakuza Ishin, focados no Japão feudal e protagonizados por heróis japoneses históricos. Destes "extras", somente Yakuza: Dead Souls veio para o ocidente. O título se passa em uma realidade alternativa, em que os personagens precisam combater uma invasão de zumbis em Tóquio.

É certo que a série Yakuza deve continuar, mesmo após a conclusão da história de Kazuma Kiryu em Yakuza 6. Contudo, os fãs devem aguardar mais relançamentos, no formato de Yakuza Kiwami, para plataformas mais recentes.